Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms