Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssh3Q8K330 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms