Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdc34Q8CFI2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdc34Q8CFI2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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