Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc28bQ8CEG5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms