Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc17Q8CE13 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms