Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc87Q8CDL9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms