Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vwc2Q8C8N3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms