Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc90bQ8C3X2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms