Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1W1

Vash1, Vasohibin-1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vash1Q8C1W1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Vash1Q8C1W1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Vash1Q8C1W1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Vash1Q8C1W1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Vash1Q8C1W1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Vash1Q8C1W1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Vash1Q8C1W1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Vash1Q8C1W1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Vash1Q8C1W1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Vash1Q8C1W1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Vash1Q8C1W1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Vash1Q8C1W1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Vash1Q8C1W1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vash1Q8C1W1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms