Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp5Q8BX09 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms