Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ctdsp2Q8BX07 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ctdsp2Q8BX07 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ctdsp2Q8BX07 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ctdsp2Q8BX07 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ctdsp2Q8BX07 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ctdsp2Q8BX07 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Ctdsp2Q8BX07 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Ctdsp2Q8BX07 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Ctdsp2Q8BX07 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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