Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Usp38Q8BW70 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Usp38Q8BW70 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
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Usp38Q8BW70 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Usp38Q8BW70 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Usp38Q8BW70 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Usp38Q8BW70 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Usp38Q8BW70 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Usp38Q8BW70 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Usp38Q8BW70 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp38Q8BW70 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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