Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms