Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc9Q8BJN4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms