Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ83

Tm2d3, TM2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d3Q8BJ83 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d3Q8BJ83 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm2d3Q8BJ83 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms