Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe23Q8BGW3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms