Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Vipas39Q8BGQ1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Vipas39Q8BGQ1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vipas39Q8BGQ1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Vipas39Q8BGQ1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Vipas39Q8BGQ1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Vipas39Q8BGQ1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Vipas39Q8BGQ1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Vipas39Q8BGQ1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Vipas39Q8BGQ1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Vipas39Q8BGQ1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Vipas39Q8BGQ1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Vipas39Q8BGQ1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Vipas39Q8BGQ1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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