Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Best2Q8BGM5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Best2Q8BGM5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms