Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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