Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms