Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Cldn34b3Q80ZS5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Cldn34b3Q80ZS5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Cldn34b3Q80ZS5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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