Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
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Amigo1Q80ZD8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Amigo1Q80ZD8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Amigo1Q80ZD8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amigo1Q80ZD8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amigo1Q80ZD8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amigo1Q80ZD8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Amigo1Q80ZD8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Amigo1Q80ZD8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amigo1Q80ZD8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amigo1Q80ZD8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Amigo1Q80ZD8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Amigo1Q80ZD8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Amigo1Q80ZD8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
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Amigo1Q80ZD8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Amigo1Q80ZD8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Amigo1Q80ZD8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Amigo1Q80ZD8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Amigo1Q80ZD8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Amigo1Q80ZD8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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