Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrde2Q80XC6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrde2Q80XC6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms