Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Pcsk9Q80W65 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Pcsk9Q80W65 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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Pcsk9Q80W65 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Pcsk9Q80W65 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcsk9Q80W65 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms