Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmcc2Q80W04 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmcc2Q80W04 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmcc2Q80W04 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmcc2Q80W04 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmcc2Q80W04 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmcc2Q80W04 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmcc2Q80W04 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmcc2Q80W04 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmcc2Q80W04 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmcc2Q80W04 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmcc2Q80W04 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmcc2Q80W04 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmcc2Q80W04 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmcc2Q80W04 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmcc2Q80W04 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmcc2Q80W04 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmcc2Q80W04 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmcc2Q80W04 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmcc2Q80W04 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmcc2Q80W04 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc2Q80W04 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms