Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otop3Q80UF9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Otop3Q80UF9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms