Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cul9Q80TT8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cul9Q80TT8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cul9Q80TT8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cul9Q80TT8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cul9Q80TT8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cul9Q80TT8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cul9Q80TT8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cul9Q80TT8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cul9Q80TT8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cul9Q80TT8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cul9Q80TT8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cul9Q80TT8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cul9Q80TT8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cul9Q80TT8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cul9Q80TT8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms