Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ube2q1Q7TSS2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2q1Q7TSS2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms