Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Dsg1cQ7TSF0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1cQ7TSF0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms