Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sys1Q78S06 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms