Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eci3Q78JN3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eci3Q78JN3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms