Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mindy1Q76LS9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mindy1Q76LS9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms