Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd3eapQ76KJ5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms