Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3alQ768S4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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