Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2r2Q6ZWZ2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2r2Q6ZWZ2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2r2Q6ZWZ2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2r2Q6ZWZ2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2r2Q6ZWZ2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2r2Q6ZWZ2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2r2Q6ZWZ2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2r2Q6ZWZ2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2r2Q6ZWZ2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms