Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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