Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ncapd3Q6ZQK0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms