Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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