Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN9

Rab35, Ras-related protein Rab-35, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab35Q6PHN9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab35Q6PHN9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab35Q6PHN9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab35Q6PHN9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab35Q6PHN9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab35Q6PHN9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab35Q6PHN9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab35Q6PHN9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab35Q6PHN9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab35Q6PHN9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab35Q6PHN9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms