Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HjurpQ6PG16 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HjurpQ6PG16 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms