Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc3bQ6PDC0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc3bQ6PDC0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms