Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhb9Q6PB60 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms