Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gapvd1Q6PAR5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gapvd1Q6PAR5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms