Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Soga3Q6NZL0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms