Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krt77Q6IFZ6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt77Q6IFZ6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms