Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud6aQ6IE21 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms