Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hecw2Q6I6G8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hecw2Q6I6G8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms