Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nckap5lQ6GQX2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nckap5lQ6GQX2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms