Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cep170Q6A065 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cep170Q6A065 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cep170Q6A065 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cep170Q6A065 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cep170Q6A065 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cep170Q6A065 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cep170Q6A065 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cep170Q6A065 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cep170Q6A065 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cep170Q6A065 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Cep170Q6A065 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cep170Q6A065 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cep170Q6A065 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Cep170Q6A065 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cep170Q6A065 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cep170Q6A065 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cep170Q6A065 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms