Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fgd6Q69ZL1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fgd6Q69ZL1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Fgd6Q69ZL1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms